除此之外,两者在机构设置、人员编制、管理体制等方面也存在差异。市属事业单位规模较大,职能多样化,管理比较复杂;区属事业单位则规模相对较小,职能相对集中,管理相对简单。
此外,市属事业单位的资金来源和使用也更为广泛,包括市级预算拨款、各类基金、社会捐赠等;而区属事业单位则主要依靠区级预算拨款为主。