1、性质不同：艾草是属于菊科蒿属植物，多年生草本或略成半灌木状，植株有浓烈香气。蒿子属于植物类，可食用，也可以常用于配料。
2、高度不同：从高度上来说蒿草的高度要低一些，主干也比较细小，茎部呈暗红色，长势最好的蒿草，只有10厘米左右，而艾叶就不同了，主干略粗长，茎部呈淡绿色，有的直径可达1.5厘米，高度在80一250厘米之间。
3、叶子的形态不同：蒿草叶的表面，会有一层白色绒毛，柔软而光滑，叶片小，其周围的锯齿纹路深，整个叶片呈狭长状；而艾叶表面为灰绿色，白色绒毛在背面，其叶面宽而肥大，叶片相对于蒿草更宽大，叶片周围的锯齿也小得多。