宝宝消化不良出现拉肚子时，首先要减少膳食量以减轻肠道负担，限制脂防以防止低级脂肪酸刺激肠壁，限制碳水化合物，以防止肠内食物发酵促使肠道蠕动增加。也就是说应该给宝宝以清淡饮食，以利于其肠道修复。
用母乳喂养的宝宝，腹泻时不必停止喂奶，只需适当减少喂奶量，缩短喂奶时间，并延长喂奶间隔。每次喂奶前，母亲可喝一大碗开水，稀释母乳，有利于减轻宝宝腹泻症状。吃辅食的宝宝要以吃面汤、米汤、米粉为主。
药物治疗
在临床上，宝宝拉肚子80%是肠道菌群失调。家长可在医生指导下，给宝宝喂点益生菌，能促进消化，调理肠胃，平衡肠道菌群及恢复正常的肠道pH值，缓解腹泻症状。
不提倡给宝宝服用抗生素，如果过多的服用抗菌药，会导致肠道菌群紊乱，反而会发生抗菌药诱导性肠道感染。
及时补水补盐
由于宝宝拉肚子，水与盐分丢失过多，如果不及时补充流失的电解质，宝宝很容易出现脱水症状，因此，为预防腹泻的宝宝脱水，家长要及时给腹泻的宝宝补充盐水。
如果宝宝拉肚子症状长时间未缓解，或者精神萎靡、脱水等现象，建议家长及时送宝宝去医院就诊，以免耽误宝宝的病情。
做好肛周护理宝宝消化不良拉肚子时，家长要做好臀部清洁护理，避免产生红臀。每次大便后，用温水清洗肛周，再用软布轻轻擦拭，涂上护臀膏，注意及时更换尿布，避免尿液浸渍皮肤。宝宝屁股发红时，暴露臀部，晒晒小屁股，保持局部干燥。
食疗方法脱脂奶
将牛奶煮沸，待冷却后除去脂肪膜，再煮沸余乳，再冷却后去脂肪膜，如此反复3次即可。脱脂奶适用于呕吐、腹泻、消化不良等患儿。
焦米汤
将大米洗干净，晾至半干炒成焦黄色，100毫升水中加炒焦米6克，用文火煮1小时，过滤去渣，再加0．4％的食盐煮沸后即可。焦米汤中淀粉变成糊精，易于消化。适用于严重腹泻及消化不良的患儿。
胡萝卜汁
先用胡萝卜500克，洗净捣碎，加入少许水煮10～15分钟，用纱布过滤，加水至1000毫升，再加3～5％的蔗糖煮沸倒入瓶中，煮5～10分钟消毒后饮用。胡萝卜汁是碱性食物，含有果胶，能促进大便形成和吸附细菌的作用。
苹果泥汤
取熟透苹果500～700克，洗净后捣成泥状，放入淡茶水中。苹果纤维较细，对肠道的刺激小，并富含碱性及果胶，有吸附、收敛作用，适用于1岁以上的拉肚子患儿。