品牌合作伙伴关系中的知识产权问题是一个非常重要的问题，因为如果处理不好，可能会导致双方合作失败或产生不必要的纠纷。以下是一些处理品牌合作伙伴关系中的知识产权问题的建议：
1.明确知识产权归属。在合作协议中，应该明确双方在合作过程中所使用的知识产权的归属。这包括商标、专利、版权等。同时，还应该说明在合作结束后，知识产权的归属是否发生变化。
2.签署保密协议。品牌合作伙伴关系中，双方可能会涉及到商业机密的保护问题。因此，双方应该签署保密协议，明确双方在合作过程中所涉及到的商业机密的保护责任。
3.建立知识产权管理体系。为了更好地管理知识产权，建议品牌合作伙伴建立完善的知识产权管理体系。该体系包括信息收集、分析、评估、保护、授权等环节，可以为品牌合作伙伴关系的顺利发展提供有力保障。
4.加强知识产权意识。品牌合作伙伴关系中，每个人都应该有一定的知识产权意识。合作双方应该加强对知识产权保护的宣传和教育，提高双方的知识产权意识，减少知识产权侵权的风险。
总之，在品牌合作伙伴关系中，知识产权问题是一个需要重视的问题。双方应该在合作前就充分了解对方的知识产权情况，建立完善的合作协议，并加强知识产权意识和保护措施，以保证合作关系的顺利发展。