起诉书的格式由首部、被告人(被告单位)的基本情况、案由和案件的审查过程、案件事实、证据、起诉的根据和理由、尾部七个部分组成。
起诉书的首部由人民检察院的名称和文号两部分组成。除高检院外，各地方人民检察院的名称前应写明省(自治区、直辖市)的名称；对涉外案件提起公诉时，各级人民检察院的名称前均应注明“中华人民共和国”字样。文号由制作起诉书的人民检察院的简称、案件性质、起诉年度、案件顺序号组成。
起诉书的尾部有两部分组成，一是具体承办案件公诉人的法律职务和姓名；二是起诉书的年月日，为签发起诉书的日期。
起诉书的正文的主要内容包括：
(1)、被告人的基本情况，包括被告人的自然情况、是否受过刑事处罚、采取强制措施的情况；
(2)、案由和案件来源，包括退回补充侦查、延长审查起诉期限等情况；
(3)、案件事实，包括犯罪的时间、地点、经过、手段、动机、目的、危害后果等与定罪量刑有关的事实要素；
(4)、起诉的根据和理由，包括被告人触犯的刑法条款、犯罪的性质、法定从轻、减轻或者从重处罚的条件，共同犯罪被告人应负的罪责等。要结合犯罪的构成要件进行概括性的表述，突出本罪的特征，语言要精练、准确；对法律条文的应用，要准确、完整、具体，写明条、款、项。
案件事实部分，是起诉书的重点。对起诉书指控所犯有犯罪事实，无论是一人一罪、多人一罪，还是一人多罪、多人多罪，都必须逐一列举。叙写案件事实，要按照合理的顺序进行。一般可以按照时间的先后顺序：一人多罪的，应当按照各种犯罪的轻重顺序叙写，把重罪放在前面，把次罪放在后面；多人犯罪的，应当按照主犯、从犯或者重罪、轻罪的顺序叙述，突出主犯、重罪。叙写案件事实，可以根据案件事实的不同情况，采取相应的表达方式。对于有证据证明的，特别是属于犯罪构成要件或者与定罪量刑事实要素，必须详细写明，做到层次清楚，重点突出；对于没有证据证明或者证据不足，以及与定罪量刑无关的事实，要避免写入起诉书或者策略性的简化处理；对作案多起但犯罪手段、危害结果等方面相同的案件事实，可以先对相同的情况进行概括叙述，然后再逐一列举每期事实的具体时间、结果等情况。