自费疫苗是可以使用医保卡来报销。如果参保人员所产生的医疗费用在基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准等范围之内的，就可以用医保卡来直接进行结算。
1、疫苗由公共卫生负担，按照国家医疗保障待遇清单规定，不属于医保基金支付范围。个人账户资金除用于支付参保职工在定点医药机构发生的医保政策范围内自付费用外，可以用于支付参保职工本人及其配偶、父母、子女在定点医疗机构就医发生的由个人负担的医疗费用，在定点零售药店购买药品、医疗器械、医用耗材发生的由个人负担的费用，配偶、父母、子女参加居民基本医疗保险、长期护理保险、政府指导的普惠型商业医疗保险个人缴费。个人账户资金不得用于公共卫生费用、体育健身、养生保健消费、健康体检等不属于基本医疗保险保障范围的支出。
2、自费疫苗即第二类疫苗，是指由公民自费并且自愿受种的疫苗。目前常用的需自费接种疫苗有水痘疫苗、手足口病疫苗、轮状病毒疫苗、流感疫苗、肺炎疫苗、人乳头瘤病毒（HPV）疫苗、带状疱疹疫苗等。
法律依据：
1、《中华人民共和国社会保险法》第二十六条
职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。
2、《中华人民共和国社会保险法》第二十八条
符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。
3、《中华人民共和国社会保险法》第二十九条
参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。
社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。
4、《中华人民共和国社会保险法实施细则》第八条 参保人员在协议医疗机构发生的医疗费用，符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准的，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。