自费疫苗不打一般是不会影响孩子上学的，因为自费疫苗属于二类疫苗，不属于国家强制接种的范围，
一类疫苗，也就是免费疫苗是一定要打的，自费的疫苗是选择性的，不大打也可以上学，但是现在很多幼儿园要求必须接种了水痘疫苗才可以入园，因此，也要根据各地的入学政策灵活给孩子接种自费疫苗，以免影响孩子上学。幼儿园入学必打自费疫苗名单，虽然自费疫苗国家不强制，但是为了宝宝的健康，建议只要家里经济条件允许，都建议在入学前给孩子接种，因为这些自费疫苗对孩子的生长发育是有好处的，能够预防很多的疾病，可以给宝宝的健康保驾护航。
不打不让上学的一类疫苗：
1、卡介苗
卡介苗是预防结核病的，刚出生就要接种，一般情况下人的一生只接种一次，现在结核病还没有消灭，得了以后治疗很麻烦，所以出生后由于各种原因没有接种的要记得去接种。
2、乙肝疫苗
乙肝疫苗是预防乙肝的，宝宝刚出生、1个月、6个月各接种一次，中国是乙肝大国，得了以后治疗也很麻烦，长大了找工作也会受到歧视，所以没有接种的或者接种后没有产生抗体的需要及时去补接。
3、脊灰减毒活疫苗
脊髓灰质炎三价混合疫苗是预防脊髓灰质炎，俗称小儿麻痹症，这个疫苗是吃的，在宝宝2个月大、3个月大、4个月大、4岁各接种一次，据说中国已经消灭了小儿麻痹症，只有少数非洲国家还有，小儿麻痹症会导致瘫痪，虽然说消灭了，还是吃了放心。
4、百白破
百白破是预防百日咳、白喉、破伤风的，在宝宝31月大、4个月大、5个月大、2岁各接种一次，百日咳、白喉使用抗生素有效，不过既然能打疫苗预防，何必等得了后再治疗，破伤风就厉害了，死亡的几率很大，所以还是要按时去接种。
幼儿园入学必打自费疫苗名单
由于儿童抵抗力较弱，很容易发生疾病，再加上幼儿园孩子较多，一旦有人出现疾病，很容易造成传染，因此，为确保孩子健康无恙，这几种自费疫苗在上学之前还是有必要打的：
1、13价肺炎疫苗
肺炎球菌疾病是肺炎球菌感染造成的—系列疾病的统称，会导致瘫痪、智力低下和耳聋等严重后遗症，甚至死亡，在流感季节，流感继发肺炎球菌感染是导致严重疾病甚至死亡的常见原因，所以给婴儿接种13价肺炎疫苗非常有必要。
2、五价轮状病毒疫苗
轮状病毒感染以后，会引起孩子腹泻、严重的脱水，以及水电解质紊乱甚至造成休克，而且轮状病毒具有很强的传染性，而5价轮状病毒疫苗对轮状病毒五种血清型重度胃肠炎保护效力较高，所以给婴儿接种五价轮状病毒疫苗非常有必要。
3、水痘疫苗
水痘是由感染水痘—带状疱疹病毒引发的以皮肤出疹为特征的传染病，具有高度传染性，尤其是在儿童中，主要传播途径为空气飞沫、直接接触和母婴垂直传播，对感染水痘的宝宝，只能隔离，接种水痘疫苗后5年内，70~90%的人可预防水痘的发生，95%的人可预防严重水痘的发生，所以接种水痘疫苗是非常有必要的。
4、肠道EV71型疫苗
肠道病毒71型的疫苗，指的是手足口的疫苗，肠道病毒71型出了导致的手足口病比较严重之外，它有可能导致婴儿中枢神经系统的病变，所以预防手足口病非常重要，而预防手足口最简单的方法就是注射肠道EV71型疫苗。
法律依据
《中华人民共和国传染病防治法》
第十五条 国家实行有计划的预防接种制度。国务院卫生行政部门和省、自治区、直辖市人民政府卫生行政部门，根据传染病预防、控制的需要，制定传染病预防接种规划并组织实施。用于预防接种的疫苗必须符合国家质量标准。
国家对儿童实行预防接种证制度。国家免疫规划项目的预防接种实行免费。医疗机构、疾病预防控制机构与儿童的监护人应当相互配合，保证儿童及时接受预防接种。具体办法由国务院制定。
第十六条 国家和社会应当关心、帮助传染病病人、病原携带者和疑似传染病病人，使其得到及时救治。任何单位和个人不得歧视传染病病人、病原携带者和疑似传染病病人。
传染病病人、病原携带者和疑似传染病病人，在治愈前或者在排除传染病嫌疑前，不得从事法律、行政法规和国务院卫生行政部门规定禁止从事的易使该传染病扩散的工作。