1985年，明?法师为纪念应慈法师圆寂二十周年题词一首：
佛学耆宿仰应公，德重道高四众崇。
一片丹心爱祖国，大悲宠愿护禅宗。
经谈般若真空理，教演华严玄妙功。
二十年前撇手去，今朝又显六神通。
“革命”中，沉香阁被工厂占用。为了落实宗教政策，市政府花大力气协调各方面关系，搬迁工厂，将沉香阁移交给佛教团体管理使用。现沉香阁内还建有“应慈法师纪念堂”，每天都有许多国内外信徒、游人前来瞻礼、参观。
1989年落实宗教政策，开始边修复边开放。经上海市佛教协会与市文管部门研究，决定按照明清古建筑格局修复沉香阁。经过五年整修，沉香阁又重现了明清时期的旧貌。四柱三间三牌楼的山门，基本保存了原有的石柱和部分构件;天王殿正中奉天冠弥勒、韦驮、四大金刚;大雄宝殿中奉卢舍那佛、文殊、普贤、梵王、帝释，两旁为十八罗汉坐像，扇墙后为海岛观音;后殿为全寺主体建筑“沉香阁”——观音楼。前后三进，两边耳房为配殿、僧寮，结构完整，布局紧凑。
现在的沉香阁，中轴线上，第一个建筑是修复的明代石牌楼，飞檐斗拱，气宇轩昂，著名书法家沙孟海先生题写的匾额“沉香阁”悬挂在上面。
第二进是天王殿，天冠弥勒、韦驮和四大天王像全部新塑装金。天王殿里，一般都塑有四大天王，故称为天王殿。明清以后的四天王像，基本成为定式，即东方持国天王，白面，手执琵琶;南方增长天王，黑面，手执宝剑;西方广目天王，红面，手执一条龙或蛇;北方多闻天王，绿面，手执一柄大宝幢(雨伞)。
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