国际微生物学会联合会（International Union of Microbiological Societies，IUMS）病毒学组设立的国际病毒分类委员会（The International Committee on Taxonomy of Viruses，ICTV）制定了《国际病毒分类与命名原则》（The International Code of Virus Classification and Nomenclature）。病毒及类病毒的分类阶元（taxon）的规则简述如下：
目：病毒的目以“-病毒目”（-virales）为词尾；
科：病毒的科以“-病毒科”（-viridae）为词尾，类病毒的科以“-类病毒科”（-viroidae）为词尾；
亚科：病毒的亚科以“-病毒亚科”（-virinae）为词尾；
属：病毒的属以“-病毒属”（-virus）为词尾，类病毒的属以“-类病毒属”（-viroid）为词尾；
种：病毒的种
病毒分类不使用界、门、纲这几个阶层。
根据病毒的基因组组成及复制方式，病毒分为如下几类：
• 病毒（Viruses）
o
DNA病毒（DNA Viruses）
▪
第一组：双链DNA病毒（Group I: dsDNA Viruses）
▪
第二组：单链DNA病毒（Group II: ssDNA Viruses）
o
RNA病毒（RNA virus）
▪
第三组：双链RNA病毒（Group III: dsRNA Viruses）
▪
第四组：正链RNA病毒（Group IV: (+)ssRNA Viruses）
▪
第五组：负链RNA病毒（Group V: (-)ssRNA Viruses）
o
DNA与RNA逆转录病毒（DNA and RNA Reverse Transcribing Viruses）
▪
第六组：RNA逆转录病毒（Group VI: RNA Reverse Transcribing
Viruses）
▪
第七组：DNA逆转录病毒（Group VII: DNA Reverse Transcribing
Viruses）
• 亚病毒因子（Subviral Agents）
o
卫星（Satellites）
o
类病毒（Viroids）
o
朊毒体（Prions）
也可以根据病毒的细胞生物宿主，分为“细菌病毒”、“真菌病毒”、“植物病毒”、“无脊椎动物病毒”、及“脊椎动物病毒”。
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