单独办理营业执照是不需要缴纳税款的，只需要缴纳手续费就可以。
企业经营之后，便应当缴纳企业所得税。
缴纳的方式有：
1、直接（上门）申报方式：没有实行税银网络划税、委托代征的纳税人可以自行到主管国税机关办理纳税申报。
2、税银网络划税方式：所有缴纳增值税、消费税的已办理税务登记的个体定期定额户（达到增值税起征点的）可实行税银网络申报纳税。
3、邮寄申报方式。
4、其他申报方式。
《中华人民共和国税收征收管理办法》
第十五条
企业，企业在外地设立的分支机构和从事生产、经营的场所，个体工商户和从事生产、经营的事业单位（以下统称从事生产、经营的纳税人）自领取营业执照之日起三十日内，持有关证件，向税务机关申报办理税务登记。税务机关应当于收到申报的当日办理登记并发给税务登记证件。
工商行政管理机关应当将办理登记注册、核发营业执照的情况，定期向税务机关通报。
本条第一款规定以外的纳税人办理税务登记和扣缴义务人办理扣缴税款登记的范围和办法，由国务院规定。
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