农村宅基地确权之后超过的部分面积的处理如下：超过合理范围的，予以拆除；超占的面积在合理范围内的，不予拆除；影响农村的整体规划的阻碍其他农民进行房屋建设、严重损害村集体利益的，必须予以拆除。
【法律依据】
《农村宅基地管理办法》第九条农村村民一户只能拥有一处宅基地，宅基地面积标准，使用耕地最高不得超过125_；使用其他土地最高不得超过140_；山区有条件利用荒地、荒坡的，最高不得超过160_。宅基地的用地面积限额为：三人及三人以下的农户75_以内，四人的农户100_以内，五人的农户110_以内；六人及六人以上的农户125_以内。使用非耕地的，每档最高可增加15_；山区有条件利用荒坡、荒山建房的，每档最高可增加35_。实施旧村改造、下山移民拆除面积超出用地限额20_以上的，可放宽一个档次的用地限额。
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