申请宅基地使用权变更一般是到市行政服务中心不动产登记窗口进行办理。
一、怎么进行宅基地使用权的变更登记
目前关于宅基地使用权变更登记与注销登记的规定，主要见于土地登记规则中。
《土地登记规则》第37条规定：“有下列情形之一的，土地使用权转让双方当事人应当在转让合同或者协议签订后三十日内，涉及房产变更的，在房产变更登记发证后十五日内，持转让合同或者协议、土地税费缴纳证明文件和原土地证书等申请变更登记：
（一）依法转让土地使用权的；
（二）因买卖、转让地上建筑物、附着物等一并转移土地使用权的；房屋所有权变更而使土地使用权变更的，在申请变更登记时，应当提交变更后的房屋所有权证书。”
第39条规定：“因交换、调整土地而发生土地使用权、所有权变更的，交换、调整土地的各方应当在接到交换、调整协议批准文件后三十日内，持协议、批准文件和原土地证书共同申请变更登记。”
第56条规定：“因自然灾害等造成土地权利灭失的，原土地使用者或者土地所有者应当持原土地证书及有关证明材料，申请土地使用权或者土地所有权注销登记。”
第58条规定：“土地使用者、所有者和土地他项权利者未按照本规则规定申请注销登记的，土地管理部门可以依照规定直接办理注销土地登记，注销土地证书。”
宅基地使用权是一种重要的用益物权。从长远发展上看，对宅基地使用权的设立、变更和消灭进行登记，既有利于加强土地管理，又有利于确认物权，减少争端。目前有些地方的宅基地使用权的登记制度不够完善，有的宅基地还没有登记。这一现状尽管还没有引发大的矛盾和纠纷，然而在宅基地使用权发生变动时就有可能对受让宅基地的人带来潜在的风险。本条考虑到我国广大农村的实际情况以及登记制度的现状，虽然没有明确要求所有宅基地使用权一旦发生变更一律登记，但是对于已经登记的宅基地使用权转让或者消灭的，则明确规定了应当及时办理变更或者注销登记。
宅基地使用权已经登记是办理变更登记或者注销登记的前提；宅基地使用权发生转让或者消灭，是办理变更登记或者注销登记的事由；在宅基地使用权转让或者消灭的法律事实发生后，已经登记的宅基地使用权应当及时办理变更登记或者注销登记。
二、宅基地使用权的内容
宅基地使用权的内容即宅基地使用权人依法享有的权利和承担的义务。
1、宅基地使用权人的权利：
（1）为保有住宅而长期使用宅基地的权利。宅基地与房屋连为一体，宅基地使用权人对宅基地享有占有权、使用权、收益权和有限制的处分权。
（2）在宅基地空闲处修建其他建筑物、设施，从事种植而取得收益的权利。
2、宅基地使用权人的义务：
（1）必须按照批准的用途使用宅基地。宅基地使用权人必须在规划的土地上建造房屋，不得擅自改变宅基地的用途，更不能买卖、出租或以其他形式非法转让宅基地。
（2）必须按照批准的面积建造房屋。不得多占土地作为宅基地。
（3）要服从国家、集体统一规划。国家、集体处于公共利益考虑，有权将宅基地进行变更，宅基地使用权人不得阻挠。但是，国家、集体要对因此受到财产损失的宅基地使用权人予以补偿。
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