员工自动离职，用人单位有证据证明因员工自离而遭受损失的，可以向员工追偿的，届时员工可能会承担损害赔偿责任，需要依据公司规章制度执行。但是公司不可以因员工自离而克扣薪资，《薪资支付暂行规章》第九条规章，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者薪资。如自离员工因此被公司克扣薪资的，可以向当地的劳动监察大队投诉或提起劳动仲裁处置解决。,法律依据：《中华人民共和国劳动法》第五十条 薪资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的薪资。《薪资支付暂行规章》第九条 劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者薪资。,法律依据：《中华人民共和国劳动法》第五十条 薪资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的薪资。,《薪资支付暂行规章》第九条 劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者薪资。
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