用R的shiny写了一个小的网页App,并托管到了shinyapps.io 用起来还挺方便的,目前只支持txt文件上传,后续在增加excel格式。
平时自己也懒得在R中敲这些代码,直接将文件上传至BItools,一键出图,然后下载图片,十分迅速。随便点两下,就能把参数和图片搞定。
最初只是为了自己使用,现在分享出来,也可以方便他人进行使用(因为有些命令还是需要额外装一些包的,使用时也要加载。)
主要功能如下:
(1)五类miRNA的绘制(主要针对联川miRNA分析结果)
(2)气泡图(如GO或KEGG富集气泡图)
(3)热图的绘制(主要参数与pheatmap一致)
(4)基因等高线图
(5)基因火山图
进阶版之:
有机会再把这些功能加上。 修改。
可点击下方原文链接进入app主页进行交互使用。
生成的图片都支持pdf下载,并且是矢量图,方便以后在AI上的
有需要的可以关注“茶与生信”公众号,并索要实例文件。 如您有好的建议或意见也可与本公众号联系。
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