天津市汉族群体15个STR基因座遗传多态性

天津医科大学学报

FTIAEDICALUNIVERSITYJOURNALONJINM

v01．16，No．4Dec．2010

665

天津市汉族群体

15个STR基因

座遗传多态性

李小廷，丁连发，洪燕敏，井连平

(天津医科大学法医学教研室，天津300070)

[关键词]法医物证学；STR基因座；遗传多态性；亲子鉴定[中图分类号]R394

[文献标识码]B

[文章编号]1006—8147(2010)04-0665—02

本文用美国ABI公司的荧光标记复合扩增系

统AmpFeSTRSinoFiler试剂盒对天津市汉族人群

1

rain；28个循环后，65℃45min；扩增产物经甲酰

胺变性后，在ABI3130遗传分析仪上进行检测，

DataCollectionl．1、GeneMapperIDv3．2软件分析。

15个STR基因座遗传多态性进行了调查，结果报

告如下。1材料与方法1．1材料

1．1．1样本57例天津市汉族无关个体血样，为本教研室日常检案积累。

1．3统计学处理采用SPSS统计软件对各基因座

基因型的观察值和期望值进行Hardy—Weinberg平

衡分析，采用Powerstats软件(美国Promega公司)

计算各个基因座的等位基因频率，基因型频率，杂合度(H)，个体识别能力(DP)，匹配概率(Pm)，非父排除率(PE)和多态性信息含量(PIC)等遗传学参数。

2结果

1．1．2试剂和仪器AmpFeSTRSinoFiler试剂盒，

ABI3130基因分析仪，ABI2720扩增仪，均为美国

ABI公司产品。

1．2方法

1．2．1DNA。1．2．2

天津市汉族群体57例无关个体15个STR基

因座等位基因及其频率分布见表1。各基因座群体

DNA提取采用Chelex一100法提取模板遗传学参数见表2。

本文在57例无关个体中，15个STR基因座共检

出154个等位基因，等位基因频率在0．009～0．530之间；共检出基因型348个，频率在0．018-0．28l之间。

PCR扩增及检测参照AmpFeSTRSinoFiler

，DNA模板Taq酶1U

试剂盒说明书，反应总体积为lo斗l，其中PCR反应混合液4“l，引物2

4

lxl，Goden

各STR基因座基因型期望值与观察值经精确检验，P值均大于0．05，均无显著性差异，符合Hardy—

Weinberg平衡。

R扩增，循环参trl；在ABI2720扩增仪中进行PC

min，94oC1min，59℃1min，72oC

数如下：95℃11

表1天津市汉族群体15个STR基因座的等位基因频率(n=57)

作者简介李小廷(1980一)，男，助教，硕士，研究向：法医物证学；通讯作者：井连平，E—mail：lxtin912345@yahoo．corn．cn。

666天津医科大学学报

第16卷

续表

D21SI

D19S433D2S1338

D18S51D6S1043FGA

D12S391

基因座

A2828．2293030．23l31．23232．233．234．2

F0．0090．0180．2280．3860．0090．096O．0790．0440．1140．0090．009

基因座

A9n

F0．0180．0090．0260．0440．0260．1930．0440．2890．140．079O．07

基因座

A12

F0．017O．0090．06O．112O．18l0。1120．0170．086O．1550．190．034O．017

基因座

A12

F0．0440．1840．228O．1750．0790．053O．0070．0090．0880．0260．0260．009

基因座

A10

F

基因座

A131618192l222323．22424．2252627

FO．0090．009O．018O．53O．1050．1750．2280．0090．1670．018O．1050．0960．009

2l

基因座

A13

F0．009O．009

0．009O．070．0790．193O．158O．026O．0180．0440．1750．009O．1140．096

H：20．0180．009O．105

tO。009O．2190．0260．1580．0090．175O．0090．0790．0960．035

m￡勉她M铊记配

O．06l

O．o()9

0．009

跎侉0．009

挎％表2天津市汉族群体15个STIR基因座群体遗传学参数基因座

H

D8S1179D21S1lD7S820CSFD3S1358D5S818D13S317D16S539D2S1338D19S433VWAD12S391D18S5lD6S1043FGA

0．9120．7890．7890．772O．7190．8070．8420．7370．8280．7720．860O．80r70．8600．842O．860

Pm0．0800．0900．1300．116O．1220．0870．0770．0800．0420．0670．082O．042O．056

0．035

3讨论

PIC

遗传学参数

DP0．9200．9lOO．870O．8840．8780．9130．9230．9200．9580．9330．9180．9580．9440．9570．946

PEO．82l0．580O．5800．5480．4590．6120．6790．4880．65lO．5480．714O．6120．7140．6790．714

l6试剂盒中研究发现AmpFeSTRIdentifilerTM

TPOX和TH01基因座的杂合度、非父排除率较低(1J，并不适合中国人群。在AmpFeSTRSinoFiler试剂盒中用D12S391和D6S1043基因座替换掉AmpFISTR

O．8l0．740．700．70O．70O．750．790．750．85O．82O．780．850．840．860．84

IdentifilerTMl6试剂盒中TPOX和TH01基因座，其各项指标在中国天津市人群中均符合亲子鉴定基因座要求。联合使用AmpFeSTRSinoFiler试剂盒中15个STR基因座，累计非父排除率>0．9999997，累积匹配概率为8．946x10‘18，累积个人识别机

率>0．999

999999

99，具有较高的识别能力。本文数

据提供了各基因座上等位基因的频率，在实际案例中，可作为计算PI值和RCP值的参考。

参考文献：

[1]杨军，牟新月，李智，等．中国鄂西土家族人群15个STR基因座

0．043

0．054

遗传多态性【刀．中国法医学杂志，2008，23(2)：119

(2010-04-4)1收稿)

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