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动物肝脏中DNA的提取

2021-11-08 来源:个人技术集锦
实验八 动物肝脏中DNA的提取 一、目的 学习和掌握用浓盐法从动物组织中提取DNA的原理和技术 二、原理 核酸和蛋白质在生物体中以核蛋白的形式存在,其中DNA主要存在于细胞核中, 应(4℃)进行, 动植物的DNA核蛋白能溶于水及高浓度的盐溶液(如1mol/L NaCl),但在0.14mol/L 的盐溶液中溶解度降低,而RNA核蛋白则溶于0.14mol/L 盐溶液,可利用不同浓度的氯化钠溶液,将脱氧核糖蛋白和核糖蛋白从样品中分别抽提出来。 将抽提得到的脱氧核糖蛋白用SDS(十二烷基硫酸钠)处理,DNA即与蛋白质分开,可用氯仿将蛋白质沉淀除去,而DNA则溶解于溶液中。向含有DNA的水相中加入冷乙醇,DNA即呈纤维状沉淀出来。 三、实验器材 1. 猪肝。 2. 722型(或7220型)分光光度计。 3. 匀浆器 4. 量筒50ml(×1)、10ml(×1)。 5. 离心机(5000r/min)。 6. 离心管。 7. 试管及试管架。 8. 吸管0.50ml(×2)、1.0ml(×2)、2.0ml(×2)、5.0ml(×1)。 四、实验试剂 1.0.1mol/L NaCl-0.05mol/L柠檬酸钠(pH6.8)。 2.0.015mol/L NaCl-0.0015mol/L 柠檬酸三钠溶液:氯化钠0.828g 及柠檬酸三钠0.341g溶于蒸馏水,稀释至1000ml。 3.95%乙醇(A.R.)。 4.NaCl固体(A.R.)。 5.5%SDS溶液:5g SDS溶于100ml 水中。 6.氯仿(A.R.)。 7.V(氯仿):V(异戊醇)混合液20:1。 五、操作 1. 称取猪肝8g,用匀浆器磨碎(冰浴),加入相当于2倍肝重的0.1mol/L NaCl-0.05mol/L柠檬酸钠缓冲液,研磨三次,然后倒出匀浆物,匀浆物在4000r/min 下离心10min;沉淀中再加入25ml缓冲液,于4000r/min 离心20min;取沉淀。 2. 在上述沉淀中加入40ml 0.1mol/L NaCl-0.05mol/L柠檬酸钠缓冲液、20mlCHCl3-异戊醇混合液、4ml 5% SDS使其终浓度为0.41%,振摇30min,然后缓慢加固体NaCl,使其浓度为1mol/L(约3.6g)。将上述混合液在3500r/min离心20min,取上清水相。 3. 在上述水相溶液中加入等体积冷95%乙醇,边加边用玻璃棒慢慢搅动,将缠绕在玻棒上的凝胶状物用滤纸吸去多余的乙醇,即得DNA粗品。用蒸馏水溶解并定容至50ml,用二苯胺法测定DNA含量。 4. 提纯将上述所得的DNA粗品置于20ml 0.015mol/L NaCl-0.0015mol/L 柠檬酸三钠溶液中,加入1倍体积的氯仿-异戊醇混合液,振摇10min,离心(4000r/min,10min),倾出上层液(沉淀弃去),加入1.5 倍体积95%乙醇,DNA即沉淀析出。离心,弃去上清液,沉淀(粗DNA)按本操作步骤重复一次。最后所得沉淀用无水乙醇洗涤2次,真空干燥。 四、实验结果 是否可见DNA?颜色如何?有无断裂现象? 实验九 酵母RNA的提取和定性检测 【实验目的】 1.学习稀碱法提取RNA的原理和操作方法 2. 掌握RNA组分的鉴定方法 【实验原理】 酵母中含有丰富的RNA(可达酵母干重的2.62%~10%),是工业上大规模制备核酸和核苷酸的原料。稀碱法是工业上常用的RNA提取方法,是用稀碱溶液使细胞裂解,使RNA释放到碱液中,然后用酸中和,除去蛋白质和菌体后的上清液用乙醇沉淀RNA;或用酸调整pH至2.5,利用等电点沉淀RNA。 RNA用H2SO4水解时,可以生成磷酸、戊糖和碱基,各种成分以下列反应鉴定:①磷酸:用强酸使RNA中的有机磷消化成无机磷,后者与定磷试剂中的钼酸铵结合成磷钼酸铵(黄色沉淀),当有还原剂存在时磷钼酸铵立即转变成蓝色的还原产物—钼蓝。②核糖:RNA与浓盐酸共热时,发生降解,形成的核糖继而转变成糠醛,后者与苔黑酚反应,在Fe3+或Cu2+催化下生成鲜绿色复合物。③嘌呤碱与AgNO3能产生白色的嘌呤银化合物沉淀。 【器材与试剂、】 (一) 器材 1. 150ml锥形瓶 2. 沸水浴 3. 量筒 4. 移液管 5. 吸管及滴管 6. 布氏漏斗和抽滤装置 7. 试管、试管夹及试管架 8. 离心机 9. 滤纸 10. pH试纸 11. 烧杯 12. 天平 13. 酵母粉 (二) 试剂 1. 0.2% NaOH溶液 2. 95%乙醇 3. 冰乙酸 4. 无水乙醚 5. 1.5mol/L H2SO4 6. 浓氨水 7. 5%AgNO3溶液 8. 苔黑酚乙醇溶液 称取苔黑酚6g,溶解于95%乙醇100ml (冰箱中可保存1个月)。 9. FeCl3的浓盐酸溶液 取10%FeCl3 2ml,与浓盐酸400ml混合。 10. 定磷试剂 (1)17%H2SO4溶液 (2)2.5%钼酸铵溶液 (3)10%抗坏血酸溶液(贮存于棕色瓶中,溶液在冰箱放置可用1个月。溶液呈淡黄色时可用,如呈深黄色或棕色则已失效。) 临用时将上述3种溶液与水按如下比例混合(限当天使用): 17%H2SO4:2.5%钼酸铵:水:10%抗坏血酸=1:1:2:1(V:V) 【实验步骤】 (一) RNA的粗提取 1. 取酵母粉5g,置于100ml烧杯中,加入0.2%NaOH溶液20ml,搅拌成悬浮液。 2. 将悬浮液在沸水浴中加热30min,冷却至室温,分两管4000rpm离心10min。 3. 将上清液缓缓倾入95%乙醇30ml中,注意边搅拌边缓缓倾入,用冰乙酸调pH值至2.5。静置,待RNA沉淀完全后,3000rpm离心3min。 4. 弃上清,以95%乙醇10ml洗涤沉淀,3000rpm离心3min。再用95%乙醇10ml洗涤沉淀,并移入布氏漏斗中抽滤。 5. 用无水乙醚洗涤沉淀2次,每次20ml,于布氏漏斗中抽滤至沉淀干燥。 (二) 水解RNA 将提取的RNA加入5ml 10% H2SO4中,沸水浴加热10min,使RNA水解。 (三) RNA组分鉴定 1. 嘌呤碱:取试管1支,加入水解液1ml,浓氨水2ml,5%的AgNO3 1ml,观察是否产生白色絮状嘌呤银化物沉淀(放置后可能变为棕黑色)。 2. 戊糖:取试管1支,加入水解液1ml,苔黑酚-FeCI3溶液1ml,在沸水浴中加热,观察试管中颜色变化。 3. 磷酸:取试管1支,加入水解液1ml和定磷试剂1ml,在沸水浴中加热,观察试管中颜色变化。 【要点提示】 1.苔黑酚(又名地衣酚,3,5-甲苯二酚) 鉴定戊糖时特异性较差,凡属戊糖均有此反应。微量DNA无影响,较多DNA存在时有干扰作用,在试剂中加入适量CUCl2·2H2O可减少DNA的干扰,甚至某些戊糖持续加热后生成的羟甲基糠醛也能与地衣酚反应,产生显色复合物。 2. 苔黑酚鉴定戊糖时也可用下列配方: (1)苔黑酚试剂:FeCI3 0.1g溶于浓盐酸100ml,摇匀,贮存备用。使用前加入苔黑酚0.476g。 (2)苔黑酚试剂:苔黑酚0.1g溶于浓盐酸100ml中,再加FeCI3 0.1g(临用前配制)。 3.RNA中磷酸的鉴定方法有两种,原理如下: (1)钼酸铵试剂鉴定: 钼酸铵试剂:钼酸铵2g溶解于10%的硫酸100ml。 强酸使RNA分子中的有机磷消化成无机磷,使与钼酸铵试剂中的钼酸铵结合成磷钼酸铵(NH4)3PO4·12MoO3(黄色沉淀)。 PO43-+3NH4++12MOO42-+24H+=(NH4)3 PO4·12MOO3·6H2O↓+6H2O (2)定磷试剂鉴定:上述反应当有还原剂存在时,MO6+被还原成MO4+,此Mo4+再与试剂中的其它MO42-结合成MO(MOO4)2或MO3O8,呈蓝色,称为钼蓝。在一定浓度范围内,蓝色的深浅和磷含量成正比,因此也可用分光光度法定量测定RNA。 4.用乙醇沉淀RNA时,需用酸中和稀碱,可以加冰乙酸至pH2.5,也可以直接用酸性乙醇(浓盐酸1ml加入乙醇100ml中)至溶液pH至2.5。 5.用AgNO3鉴定RNA中的嘌呤碱时,除了产生嘌呤银化物沉淀外,还会产生磷酸银沉淀,磷酸银沉淀可溶于氨水,而嘌呤银化物沉淀在浓氨水中溶解度很低,加入浓氨水可消除PO43+的干扰。 【思考题】 1.用苔黑酚鉴定RNA时加入Cu2+或Fe3+的目的是什么? 2.用AgNO3鉴定嘌呤碱基时加入浓氨水的目的是什么?

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